羊水细胞性染色质检查用以预测胎儿性别，以估计某些遗传性疾病的可能发生概率。
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正常值
X染色质：>0.06为女性胎儿，0.05为男性胎儿，<0.04为女性胎儿。
临床意义对有X性连锁隐性遗传病家族史者来说，父母表型正常，如母亲为致病基因携带者，其子女中儿子患病的概率是50%;女儿则表型正常，但有一半可能是携带者。当父亲为患者时，儿子全部正常，而女儿全部为携带者，如血友病A、血友病B、葡糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症、红绿色盲、假肥大性肌营养不良、先天性丙种球蛋白缺乏症等。
