脑脊液蛋白电泳主要用于多发性硬化症，神经梅毒及亚急性硬化性全脑炎等的诊断。
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正常值
滤纸法白蛋白：0.55～0.69(55%～69%)球蛋白α1：0.03～0.08(3%～8%)α2：0.04～0.09(4%～9%)β：0.10～0.18(10%～18%)γ：0.04～0.13(4%～13%)
临床意义(1)白蛋白升高：椎管梗阻、脑肿瘤、部分血管性疾病。(2)α1球蛋白：①升高：脑部感染、急性细菌性脑膜炎、脊髓灰质炎。②降低：脑外伤急性期。(3)α2球蛋白升高：脑部转移瘤、癌性脑膜炎、胶质瘤、桥脑小脑角肿瘤。(4)β球蛋白升高：多发性硬化症、亚急性硬化性全脑炎、震颤性麻痹、脑萎缩、阿尔茨海默病、手足徐动症、肌萎缩侧索硬化症、多发性神经根炎、面神经麻痹、糖尿病性周围神经炎、脑瘤(胶质瘤)、癫痫、假性脑瘤等。(5)γ球蛋白升高：多发性硬化症、亚急性硬化性全脑炎、病毒性脑炎、脑脓肿、多发性神经根炎、酒精中毒性周围神经炎、浆细胞瘤、胶质瘤、桥脑小脑角肿瘤、脑外伤、结节病、血清γ球蛋白增高(肝硬化、结缔组织疾病、多发性骨髓瘤)等。
