1、类风湿性关节炎：其关节炎表现甚至X线表现均与本征有相似之处，故Cecil曾将Reiter综合征列入类风湿性关节炎的临床异型中。但一般类风湿关节炎不会同时出现尿道，结膜炎及皮肤粘膜损害。
2、强直性脊柱炎：本征慢性脊柱病变患者必须与强直性脊柱炎相鉴别，两者眼症和X线表现无较大差异，但如先有关节周围炎伴有尿道炎史，特别有溢脓性卡他性皮肤角化病表现，则支持Reiter综合征。
3、淋病性关节炎：淋球菌性关节炎只限于滑膜;不侵犯关节，故关节液淋球菌培养阴性，但尿道脓性分泌物培养阳性，而本征则查不到淋病双球菌。本征虽有环状龟头炎，但不同志淋病的包皮龟头炎及尿道口红肿表现，本征皮肤损害以及溢脓性皮肤角化病为物特征，淋病则以血管脓疱性皮肤病为特征。
4、脓疱型银屑病：脓疱型银屑病与Reiter综合征的溢脓性皮肤角化病，两者之间在临床和组织学都十分相似，如银屑病累及结膜，则更容量混淆，但银屑病无尿道炎和痢疾史。
5、白塞综合征：Reiter综合征有尿道炎和关节炎，而白塞综合征则无。本征口腔和阴部损害是水疱破溃后糜烂并结痂，而白塞病则为较深的溃疡。本征极少发生于女性，而后者则女性多见。本征在我国少见，而白塞病并不少见。
