潜伏期为5～21天，平均在1周之内。临床经过可分为3期：

　　1.第1期 即外生殖器早期损害期。大致在性交感染后3天～3周，甚至3个月，在外生殖器上，如男性的冠状沟、包皮内侧、龟头或尿道口，女性的阴唇、阴道或子宫颈，出现针头大小丘疹、脓疱，并很快破溃形成溃疡。常为单个，有时2～3个，直径为1～4mm，圆形，边缘清楚，绕以红晕，触之不硬，亦无痛感，因而易被患者忽视。经过10天左右痊愈，不留瘢痕。

　　2.第2期 即腹股沟横痃期。在第1期损害发生1～4周后，腹股沟处酸痛而僵硬，旋即淋巴结开始肿大，融合成1个不甚规则、沿腹股沟略带梭形、中心高而外围较平的肿块，大小如鸡蛋或更大，表面呈紫色和青色，由于腹股沟韧带将淋巴结上下分开，皮肤呈槽沟状。各个淋巴结炎均先后化脓、穿孔，形成多数性瘘管，似“喷水壶状”，排出脓性或血液浆液，主觉疼痛，比下疳横痃要轻些，但影响行动。可有低热、食欲不振或全身不适。分布常为单侧，有时对称，后发的一侧，因已有一定的免疫力，常较小、较轻，而不一定化脓穿孔，称为顿挫性腹股沟淋巴肉芽肿横痃。女性很少发生腹股沟淋巴结炎，因其初疮常发生在阴道下部，向髂及肛门直肠淋巴结蔓延，引起髂及直肠周围淋巴结炎和直肠炎，导致腹痛及腰背痛。

　　3.第3期 即外生殖器象皮肿和直肠狭窄。距第1期1～2年。男性中象皮肿可累及阴茎（粗厚而坚实）、阴囊和下肢。同性恋者可发生肛门直肠狭窄，此在我国尚未见过。女性中象皮肿可非常突出。笔者曾见1例圆形阴唇象皮肿比鸡蛋还大，两侧阴唇像示指样向下延伸7～8cm，两侧对称，硬如象皮，略带褐色，末端微尖。开始时粪便中带脓血，逐渐排便困难，粪便形似铅笔。直肠指检发现肠壁变厚，在肛门上方5～6cm处有相当坚实之肿块。这种改变可能为环形、圆柱形或漏斗形，以后者多见。X线摄片可以证实。笔者曾见1例肛门外肿物如婴儿头大，直肠与膀胱相通。本期损害常多年不愈。

　　除上述3期所见围绕于生殖器、腹股沟和肛门的病变外，本病尚有其他少见病变，提示本病可能为全身性多系统性疾病。少见病变有：皮肤有多形红斑、结节红斑，发生于腹股沟横痃附近的红斑、结节、脓肿或溃疡。光敏皮肤反应常见：眼部有视盘周围水肿、眼底静脉扩张弯曲（治愈后消失，此病变不少见）和结膜炎。

　　其他有附睾炎、腹膜炎、溃疡性结肠炎、骨膜炎、关节炎、脑膜炎等。上海华山医院曾见1例本病引起的脑膜炎，因发生持续性癫痫而死亡。