本病的临床诊断较难，提高诊断率前提是对本病的警惕性。根据患者有不洁性接触史，尿道炎症状较淋病轻，分泌物检查找不到淋球菌，高倍镜下（400×）白细胞10～15个以上，油镜下（1000×）白细胞5个以上即可初步诊断，凡临床怀疑尿感、而反复尿细菌培养阴性者，均应及时作尿支原体检查。支原体尿感的诊断主要靠实验室检查。

　　注意与淋球菌尿路感染、衣原体尿路感染、艾滋病性尿路感染及其他细菌性尿路感染相鉴别，可借助实验室检查鉴别。