临床上应与颗粒细胞瘤，播散性豆状皮肤纤维化，透明细胞棘皮瘤，黑色素瘤等鉴别。
1.隆突性皮肤纤维肉瘤 细胞成分多;核大且有轻度异形，分裂象较多。进行性增大，直径超过2～3cm者则提示恶性纤维性组织细胞瘤，或隆凸性皮肤纤维肉瘤，应切除活检。
2.结节性痒疹 好发于四肢伸侧，多发而大小一致，不会增到很大 ，瘙痒明显而无刺痛，瘙痒明显而无刺痛，组织病理为表皮疣状或乳头状样增生，真皮内不见增生胶原纤维及组织细胞。
3.皮肤平滑肌瘤 颇似皮肤纤维瘤，但有疼痛感，组织病理检查见肿瘤由纵横交错鵻的平滑纤维束组成。胞核居中，呈杆状，两端钝圆，肌纤维束间常有胶原纤维。在HE染色下鵻，两种纤维不易区分，但用Verhoeff-van Gieson染色鵻，胶原纤维呈红色，而肌肉呈黄色;如用Masson三色染色鵻 胶原呈绿色，而肌肉呈暗红色。
4.本病还需与恶性黑瘤 结节性黄色瘤 瘢痕疙瘩鉴别。
