1、肾、输尿管肿瘤血尿特点也为全程无痛性肉眼血尿，与膀胱癌类似，可单独发生或与膀胱癌同时发生，上尿路肿瘤引起的血尿可出现条形或蚯蚓状血块，明确诊断需要B超、CT、泌尿造影等检查。
2、泌尿系结核除了血尿外，主要症状为慢性膀胱刺激症状，伴有低若热、盗汗、消瘦、乏力等全身症状，通过尿找抗酸杆菌、IVP、膀胱镜检查等与膀胱癌鉴别。
3、前列腺增生主要症状为进行性排尿困难及尿频，有时出现肉眼血尿，在老年人，膀胱癌可以和前列腺增生同时存在，需要行尿脱落细胞学、B超、CT、膀胱镜检查等鉴别。
4、尿石症血尿多为镜下血尿，上尿路结石可出现肾、输尿管绞痛，膀胱结石可出现排尿中断现象，通过KUB平片、B超、膀胱镜检查等鉴别，由于膀胱结石对局部粘膜的刺激，可导致肿瘤发生。因此，长期膀胱结石出现血尿时，应想到膀胱癌的可能，必要时行膀胱镜检查及活检。
5、腺性膀胱炎有明显的膀胱刺激症状，需要膀胱镜检及活检，单纯膀胱镜检有时误诊。
6、前列腺癌血尿癌肿浸润膀胱时出现，经直肠指诊、B超、CT、活组织检查等明确。
7、其他如放射性膀胱炎(多有盆腔放疗史，膀胱镜下有放射状毛细血管扩张、膀胱粘膜溃疡及肉芽肿，需行活检确诊)，子宫颈癌(侵人膀胱后可出现血尿，但一般先有阴道出血，阴道检查可鉴别)等。
